Molecular screening of pathogenic Escherichia coli strains isolated from dairy neonatal calves in Cordoba province, Argentina / Detección molecular de cepas patógenas de Escherichia coli aisladas de terneros neonatos de tambo en la provincia de Córdoba, Argentina

The aim of this study was to perform a current molecular characterization of bovine pathogenic Escherichia coli strains isolated from random samplings in Argentinean dairy farms. Rectal swabs were obtained from 395 (63.7 %) healthy and 225 (36.3 %) diarrheic calves, belonging to 45 dairy farms in Cordoba Province, Argentina. E. coli isolates were examined for virulence genes (f5, f41, f17, sta, stb, lt, eae, vt) using PCR and the prevalence of E. coli virulence profiles was spatially described in terms of spatial distribution. A total of 30.1 % isolates were found to be positive for at least one of the virulence genes. Depending on the different gene combinations present, 11 virulence profiles were found. Most of the isolates analyzed had a single gene, and no combination of fimbrial and enterotoxin gene was predominant. There was no association between the frequency and distribution of E. coli virulence genes and calf health status. Most of the virulence profiles were compatible with ETEC strains and showed a homogeneous distribution over the sampled area. A clustering pattern for E. coli virulence profiles could not be recognized. This work provides updated information on the molecular characterization of pathogenic E. coli strains from dairy herds in Cordoba, Argentina. These findings would be important to formulate prevention programs and effective therapies for diarrhea in calves caused by E. coli.

El objetivo de este trabajo fue realizar una caracterización molecular actualizada de cepas patógenas bovinas de Escherichia coli aisladas de un muestreo aleatorio en tambos de una de las principales zonas lecheras de Argentina. Se obtuvieron hisopados rectales de 395 terneros neonatos sanos (63,7 %) y 225 diarreicos (36,3 %) pertenecientes a 45 tambos de la provincia de Córdoba, Argentina. Los genes de virulencia f5, f41, f17, sta, stb, lt, eae y vt se analizaron mediante PCR y se investigó la prevalencia de los perfiles de virulencia en función de la distribución geográfica. La prevalencia de aislamientos de E. coli patogénicos con al menos un gen de virulencia fue del 30,1 %. Once perfiles de virulencia fueron identificados, dependiendo de la combinación de genes presentes. La mayor parte de las muestras presentó un solo gen de virulencia, y no predominó ninguna combinación de genes de fimbrias y toxinas. No hubo asociación entre la frecuencia y la distribución de los genes de virulencia y el estado de salud de los terneros. La mayoría de los perfiles de virulencia fueron compatibles con cepas ECET y se distribuyeron cubriendo toda el área geográfica muestreada. No se reconoció ningún patrón de agrupamiento espacial para dichos perfiles. Este trabajo provee información actualizada sobre la caracterización molecular de E. coli patógena en rodeos lecheros de Córdoba, Argentina. Estos resultados serían importantes para formular programas preventivos y terapias eficaces contra la diarrea bovina causada por E. coli.

Efectos de la privación de sueño en el desempeño de los médicos residentes de pediatría / Effects of sleep deprivation on medical performance of pediatric residents

Introducción. El desempeño de los médicos residentes puede ser afectado adversamente por la privación de sueño producto de las jornadas extendidas de trabajo. Objetivo. Valorar los efectos de la privación de sueño luego de la guardia sobre la velocidad de reacción, atención y memoria en los médicos residentes de pediatría. Población, material y método. Se realizó un estudio descriptivo con evaluación antes y después. Se incluyeron 44 médicos residentes, distribuidos en dos grupos. Al primer grupo (23 residentes) se le realizaron dos evaluaciones, en un día libre de guardia y luego de una guardia. El segundo grupo se evaluó sólo luego de una guardia y fue utilizado para valorar el efecto aprendizaje. Todos los participantes realizaron: cuestionario que incluyó horas de sueño, escala de sueño de Epworth, inventario de desgaste profesional (burnout) de Maslach, trail making test, prueba PASAT, span de dígitos, batería de memoria de Signoret y prueba de tiempo de reacción. Se evaluó el grado de deterioro en las pruebas luego de un día de guardia. Resultados. El promedio de horas de sueño el día de guardia fue de 3 h. Se observó deterioro significativo en las pruebas de velocidad de reacción visual (p< 0,001). Las pruebas de atención y la memoria no presentaron empeoramiento luego de la guardia. Conclusión. La velocidad de reacción resulta deteriorada por la privación de sueño que experimentan los médicos residentes.

Caracterizaciónbbiológica de variantes de placade la cepa vacunal 17d contra lla fiebre amarilla / Biological charccterisation of yellow fever 17d strain plaque variatss / Caracteriação biiológica das variantes daplaca cepa da vacina 17d contraa a febre amarela

La vacuna colombiana 17D contiene por lo menos cuatro fenotipos, denominados pequeño (0,3-1,2 mm), mediano (1,3 -2,1 mm), grande (2,2 - 3,0 mm) y extra-grande (>3,1 mm). La composición y distribución porcentual de esos fenotipos variaron entre lotes y entre ampolletas de un mismo lote. Cada variante fue clonada por dilución de la vacuna y su efecto virulento fue analizado en ratones; el fenotipo de placa pequeño estuvo ligeramente sub representado en los lotes analizados y mostró una virulencia similar a la de la cepa silvestre neurotrópica francesa (DL50 >10-6), mientras que el fenotipo predominante y más atenuado fue el mediano (DL50:10-4). Los fenotipos grande y extragrande mostraron una virulencia intermedia (DL 50:10-5) con relación a los anteriores. Los análisis de secuencia de las variantes sobre una región comprendida entre el extremo 3'NS5 y el inicio de 3'NCR mostró la cercanía entre aquellas variantes con algún grado de virulencia, y entre la variante atenuada y la vacuna colombiana. La heterogeneidad de la vacuna 17D constituye una evidencia de la estructura de cuasiespecies propia de los virus RNA, y señala cómo los casos de reacciones pos vacunales adversas pueden estar asociados con la aplicación de vacunas fabricadas a partir de cepas virales atenuadas.

The Colombian 17D vaccine contains at least four phenotypes denominated small (0.3 - 1.2 mm), medium (1.3 - 2.1 mm) large (2.2 - 3.0 mm) and extra-large (>3.1 mm). These phenotypes composition and percentage distribution vary between different production lots and between ampoules from a particular lot. Each variant was cloned by diluting the vaccine and its virulent effect was analysed in young mice. The small plaque phenotype was slightly under represented in the lots analysed and showed similar virulence to the neurotropic French wild strain (LD50 >10-6), whilst the medium- sized phe-notype predominated and was the most attenuated (LD50:10-4). The large and extra-large phenotypes showed intermediate virulence (LD50:10-5) regarding the others. Sequence analysis of variants within the region between the 3'NS5 end and the beginning of 3'NCR showed the closeness between those variants having some degree of virulence and between the attenuated variant and the Colombian vaccine. The 17D vaccine's heterogeneity constitutes evidence of RNA virus quasi-specie structure and shows how adverse yellow fever vaccine reaction can be associated with applying vaccines produced from attenuated viral strains.

A vacina colombiana 17D, contém pelo menos quatro fenótipos, denominados pequeno (0.3 - 1.2 mm), médio (1.3 -2.1mm), grande (2.2 - 3.0mm) e extra grande (>3.1 mm). A composição e distribuição percentual destes fenótipos, variou entre lotes e ampolas do mesmo lote. Cada variante foi clonada por diluição da vacina e seu efeito viral foi analisado em ratos; o fenótipo da placa pequena, esteve ligeiramente sub-representado nos lotes analisados e mostrou uma virulência similar a da cepa silvestre neurotrópica francesa (LD50 >10-6), enquanto que, o fenótipo predominante e mais atenuado foi o médio (LD50:10-4). Os fenótipos grande e extra grande mostraram um estado viral intermediário (LD50:10-5) com relação aos anteriores. As análises da seqüência das variantes sobre uma região compreendida entre o extremo 3'NS5 e o início de 3'NCR, mostrou a proximidade entre aquelas variantes com algum grau de virulência, e entre a variante atenuada e a vacina colombiana. A heterogeneida-de da vacina 17D, constitui uma evidência da estrutura de qualquer espécie própria do vírus RNA e assinala como os casos de reações pós vacinação adversas, podem estar associadas com a aplicação das vacinas fabricadas a partir das cepas virais atenuadas.

A most effective method for selecting a broad range of short and medium-chain-length polyhidroxyalcanoate producing microorganisms

A molecular approach was used for selecting polyhydroxyalcanoate (PHA)-accumulating potential Gram-negative bacteria from different genera by colony polymerase chain reaction (PCR). Three degenerate primers were designed for amplifying a fragment from PHA synthase gene (phaC) (Class I), phaC1 and phaC2 (Class II) genes for detecting PHA-producing bacteria. Thirty-four out of 55 bacterial strains from the old collection selected using Sudan black B staining were phaC+. PCR was used for directly selecting 35 new collection bacterial strains; these strains were phaC+ and their ability to produce PHA was confirmed by Sudan black B staining. Four specific primers were designed on genes of Class II PHA biosynthesis operon. These primers were used for evaluating 9 strains from the old phaC+ collection; 6 showed Class II PHA synthase organisation. 34 from the old and new bacterial isolation were characterised by 16S ribosomal gene (16S rDNA) gene partial sequencing. The tool proposed here can be used for better directing PHA production based on PHA biosynthesis genes and bacterial genera. Class I or II phaC genes were detected in 9 different genera and were able to infer the type of polymer produced.